Окончил Семипалатинскую государственную медицинскую академию (1993–1999), получив квалификацию врача общей практики.
В 2013 году прошёл переподготовку по функциональной диагностике в Алматинском государственном институте усовершенствования врачей.
Регулярно повышает квалификацию, в том числе по направлениям эндоскопии и функциональной диагностики.

Багжан Габиденович активно участвует в профессиональных обучающих программах и конференциях.
Прошёл курсы повышения квалификации по темам: «Функциональная диагностика и эндоскопия» (2013) и «Актуальные вопросы эндоскопии» (2017).
Следит за развитием современных эндоскопических технологий и внедряет новые методы обследования в свою практику.

Известен своей лёгкой рукой, аккуратностью и внимательностью.
Процедуры проводит быстро, чётко и безболезненно, создавая доверительную и спокойную атмосферу.
Для каждого пациента подбирает оптимальную тактику обследования, объясняя все этапы и результаты диагностики.